한국수자원공사 전체 연구과제 중 자체과제 비율은 61%, 수탁 36%, 위탁 3%로 나타나 대부분 자체적으로 수행하고 있지만 정부주도하의 R&D 참여확대로 인한 수탁과제 수가 증가하고 있어 관련규정 개정과 수탁과제 평가를 효율적으로 실시 할 수 있는 제도 개선이 필요하다는 지적이다.

한국수자원공사의 연구백서에 따르면 전체 연구과제 87개 중 TRM 관련 연구과제는 68개, 약 78%를 선점해 TRM을 중심으로 한 기술개발에 몰두하고 있으나 관련기술 확보와 예산집행을 고려할 때 TRM 실행 계획에 맞춘 연구과제 선정이 마련돼야 할 것으로 보인다.

기술지원에 대한 개인별 지원현황에서도 평균 참여일수는 55.2일로 연간 업무 비중의 15%정도를 차지, 전체 업무중 기술지원이 차지하고 있는 비중이 높아 전문기술을 최대로 활용할 수 있도록 하는 지원방법이나 내용에 대한 제도 개선이 필요하다는 여론이 제기되고 있다.

특히 수자원연구원이 자체적으로 글로벌화 시대를 맞아 국제협력이나 기술교류를 위해 2004년 이후 체결된 MOU 건수는 42건에 불과해 지속적인 확대노력이 있어야 할 뿐 아니라 미래 트렌드(Trend) 분석 등을 통한 공동연구 추진과 인적교류를 할 수 있는 뮤를 체결 후 실행계획 수립이 미흡해 보완이 필요하다고 강조했다.